1、抗菌
穿心莲中含有丰富的新穿心莲内酯，这种物质对于细菌性痢疾的治疗是非常有帮助的，而没有副作用和毒性。体外试验，穿心莲水煎剂及从其中分离出之粗结晶，均对钩端螺旋体的某些型别有抑制或杀灭作用，煎剂对肺炎球菌、甲链球菌及卡他球菌有一定抑制作用。
2、抗病毒
穿心莲煎剂对孤儿病毒ECHO11引起的人胚肾细胞的退变有延缓作用。穿心莲在体外试验有一定的抗HIV作用。
3、解热消炎
穿心莲有着非常不错的解热作用，对于实验性炎症有显著的抑制作用。而且穿心莲有着非常好的消炎作用。临床上曾应用于多种感染性疾病，包括外伤感染、疖、痈、丹毒、上呼吸道感染、急慢性扁桃体炎、急慢性咽喉炎、急慢性支气管炎、急性菌痢、急性胃肠炎、尿路感染、子宫内膜炎、盆腔炎、中耳炎、牙周炎等，均有不同程度的疗效。
4、清化湿热
用于湿热泄泻、湿热黄疸、热淋带下。湿热泄泻，症见急性肠炎、腹痛、泻下急迫、势如水注、黄褐而臭、肛门灼热，可与黄连、滑石、白扁豆等同用。湿热黄疸，症见目睛皮肤俱黄、小便黄赤、脘腹胀满、上腹胀痛、恶心呕吐，可与黄连、栀子、茵陈、赤芍等同用;湿热下注、热淋、小便涩痛，可与黄连、滑石等同用。穿心莲对于治疗湿热带下也是非常不错的，症见带下黄白黏稠或黄水样、瘙痒，通常情况下会与与芡实、金樱子、黄柏、苦参同用。
5、免疫抑制
穿心莲对人体的免疫功能的影响比较复杂。水煎剂、内酯注射液、甲素注射液均篚增强小鼠巨噬细胞和外周白细胞的吞噬作用。穿心莲抗感染的临床疗效可能与此有关。穿心莲内酯能使小鼠胸腺萎缩，外周T细胞减少，能降低血清中抗体效价，抑制迟发型超敏反应，表明穿心莲内酯对T细胞和B细胞均有抑制作用，是一种免疫抑制剂。
7、抗栓
穿心莲黄酮成分有抗血小板聚集，改善血液黏稠度，抗血栓形成能作用，有增加心肌血流量，抗心肌梗死的作用。
8、保肝利胆
穿心莲内酯对肝损伤有显著的对抗作用，能使血清ALT、ASTAKP、SB和肝内甘油三酯下降。穿心莲内酯还有显著的利胆作用。
9、抗蛇毒
本品有显著的抗蛇毒作用，印度民间用于蛇伤有效。