为满足出口食品生产企业备案管理业务发展的需要，便利出口食品生产企业备案业务的办理，提升检验检疫监管部门监管水平，实现出口食品备案无纸化申报，质检总局、国家认监委开发了出口食品生产企业备案管理系统，于2015年1月1日起在全国检验检疫系统内全面运行。
系统正式运行后，食品企业备案业务全部在线办理，成效显著。一方面，企业可以直接在系统企业客户端注册账号并提交电子材料，检验检疫工作人员在系统中将企业提交的申请派发给评审组，评审组成员直接下载材料、上传不符合项。备案结果网上发布，备案监管情况在网上实时可查。另一方面极大地节约企业的时间和成本，同时突出流程管理、时限管理等关键点，进一步规范审批权力运行，不仅提高了审核速度，也有利于对评审过程的监督抽查，极大地提升审批效能。按照相关规定，原来出口食品生产企业备案评审及审批时限为50天，如今漳州检验检疫局该业务平均时限缩短为15天，缩短70%。